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Commit 49b44cc

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cienci reproducible
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AEET_2025/reproducible_science.qmd

Lines changed: 16 additions & 20 deletions
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@@ -33,27 +33,25 @@ The objectives of this workshop are:
3333

3434
### Workshop structure
3535

36-
| Bloques | Tiempo estimado |
37-
|-----------------------------------|-----------------|
38-
| Introducción a Git | 15 min |
39-
| Instalación Git | 15 min |
40-
| Crear un repositorios/proyecto | 15 min |
41-
| Flujo de trabajo en Git y GitHub | 45 min |
42-
| *Descanso* | 30 min |
43-
| Introducción a Quarto | 15 min |
44-
| Estructura de un documento Quarto | 15 min |
45-
| Crear un documento Quarto | 40 min |
46-
| *Mini descanso* | 10 min |
47-
| Colaborar en GiHub | 30 min |
48-
| Otras utilidades de Github | 10 min |
36+
| Bloques | Tiempo estimado |
37+
|----------------------------------------|-----------------|
38+
| Introduction to Git and GitHub | 30 min |
39+
| Repositories and R projects | 15 min |
40+
| Working flow in Git and GitHub | 45 min |
41+
| *Break* | 30 min |
42+
| Introduction to Quarto | 15 min |
43+
| Structure of a Quarto document | 15 min |
44+
| Crear un documento Quarto | 40 min |
45+
| *Break* | 10 min |
46+
| Collaborative work with Git and GitHub | 40 min |
4947

5048
## Who we are?
5149

5250
Verónica Cruz Alonso (veronica.cral\@gmail.com), Elena Quintero (elenaquintero.qb\@gmail.com) and Guillermo Fandos ()
5351

5452
And you... who are you?
5553

56-
![QR](images/mentimeter_qr_code.png) <https://www.menti.com/8fnfxiwrk7>
54+
<https://www.menti.com/alefzp9t3t17>
5755

5856
## Introducción
5957

@@ -262,17 +260,18 @@ Algunas diferencias entre Quarto y R Markdown en cuanto al código:
262260

263261
### Instalación de Quarto
264262

265-
Quarto viene instalado con las ultimas versiones de Rstudio (v2022.07 y posterior). No obstante, si se quiere utilizar tambien en otras interfaces se pueden seguir las instrucciones de instalacion en la página oficial: <https://quarto.org/docs/get-started/>.
263+
Quarto viene instalado con las ultimas versiones de Rstudio (v2022.07 y posterior). No obstante, si se quiere utilizar tambien en otras interfaces se pueden seguir las instrucciones de instalacion en la página oficial: <https://quarto.org/docs/get-started/>.
266264

267265
Para usar Quarto desde R, hay que tener instalado rmarkdown:
268266

269-
```r
267+
``` r
270268
#|eval: false
271269
install.packages("rmarkdown")
272270
```
271+
273272
Tambien se puede verificar la instalación de Quarto y su localizacion con el siguiente comando:
274273

275-
```r
274+
``` r
276275
#|eval: false
277276
quarto::quarto_path()
278277
```
@@ -307,9 +306,6 @@ Para crear un documento Quarto en RStudio, se pueden seguir estos pasos:
307306

308307
### Estructura de un documento Quarto
309308

310-
311-
312-
313309
## Flujo de trabajo en Git y GitHub
314310

315311
Git es capaz de rastrear todos los archivos contenidos en un repositorio. Para comprender cómo Git registra los cambios y cómo podemos compartir dichos cambios con nuestros colaboradores es importante entender cómo se estructura Git y cómo se sincroniza con GitHub. Hay cuatro "zonas" de trabajo:

aplicaciones_bioinformáticas/ciencia_reproducible.html

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aplicaciones_bioinformáticas/ciencia_reproducible.qmd

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