ドキュメントの整理とdocsディレクトリへの再構成 (#71)

* Initial plan

* ドキュメントをdocsディレクトリ配下に整理

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* docs/spec_all.md、SETUP.md作成、README.md更新

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* 外部APIドキュメントとセットアップドキュメントを日本語化

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* spec.md、class_spec.md、context_file_spec.mdを日本語化しMermaid図を追加

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* 主要仕様ドキュメントを日本語化しMermaid図を追加

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* 残りの仕様ドキュメントを日本語化しMermaid図を追加

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* 仕様書を実際のコードと照合して修正

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Author: Copilot