chore: 清理仓库，移除废弃与无关文件

- A 类（GitBook 时代遗留）：book.json、TwoWater-Python.json、SUMMARY.md
- B 类（README 与 mkdocs nav 均不引用的孤儿章节）：Article/{advanced,Linux,supplement}/
- C 类（孤立资源 + 政策敏感内容）：Res/
- D 类（一次性图片迁移脚本，主流程已结束）：tools/{download,sanitize,find}_*.py、SUBAGENT_PROMPT_TEMPLATE.md、__init__.py
- 保留 tools/example_runner.py，后续可接入 CI 校验代码块

Co-Authored-By: Claude Opus 4.7 (1M context) <noreply@anthropic.com>

Author: walter201230